微生物资源是国家重要的战略资源，与生物安全、人类健康、环境保护和可再生能源等密切相关。我国是一个生物资源多样性较为丰富的国家，但微生物资源收集、保藏与共享工作一直落后于许多发达国家，自2003年开始，科技部、财政部启动了国家微生物菌种资源共享平台的建设，逐步加大对微生物资源收集、整理、评价、保藏与共享工作的经费投入，以中国农业、林业、医学、药用、工业、兽医、普通、典型和海洋等9个国家级专业菌种保藏管理中心为核心，组织11个部委、19个省市76家单位共同参与国家微生物菌种资源共享平台的建设。
　　截止到目前，研究制定了60个描述规范和38个技术规程，多层次和多角度规范了资源收集、标准化整理、安全保藏及数字化表达，指导资源整理整合，为改变条块分割，资源分散、信息混乱的状况提供了依据；开发了信息检索系统，实现了信息的数据化和网络化，研发了1个共性数据库和6个各性数据库，建设10个网站，检索信息达到11.2万株；标准化收集、整理、整合各类资源11.2万株，补充2.4万余株菌的16SrDNA或18S Rdna或ITS等分子生物学信息、4.8万余株菌的重要的生理生化实验，1.6万余株菌的功能特性，补充形态特征、照片3.5万余幅，补充1万余株菌的采集环境和文献信息，菌株信息和实物共享数量和质量大幅提高。
    此外，在微生物平台建设过程中，咨询、培训6500人次，出版专著7本，发表论文69篇，申请专利17项。共享平台是社会公益性工作，累计向社会提供共享菌株3.93万份，取得间接效益约3.73亿元，社会效益约12.78亿元。